El Núcleo Académico Básico (NAB) del Instituto de Investigaciones Sociológicas de la UABJO, se encuentra integrado por 10 Profesoras/es-Investigadores/as de Tiempo Completo (PTC) con Perfil Deseable PRODEP y 3 Investigadores/as por México del Consejo Nacional de Humanidades, Ciencias y Tecnologías (CONAHCyT).Cabe destacar, que la mayoría de las/os integrantes se encuentra dentro del Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores (SNII) del CONAHCyT en sus diferentes categorías como son: Candidato/a a Investigador/a Nacional; Investigador/a Nacional con tres niveles (I, II y III) y un Investigador Nacional Emérito.
Es importante señalar que las/os miembros del NAB cultivan Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento de manera colectiva, a través de la conformación de tres Cuerpos Académicos (CA): Estudios Sociales; Género, Cultura y Desarrollo; y Estudios Políticos. Mismas que se enriquecen de las líneas individuales que cada Profesor/a-Investigador/a integrante desarrolla a través de sus proyectos, seminarios, libros y redes de investigación.
Asimismo, al formar parte del Consejo Mexicano de Ciencias Sociales (COMECSO) y del Consejo Latinoamericano de Ciencias Sociales (CLACSO), las/os integrantes del IISUABJO, se encuentran comprometidos/as con abordar y generar conocimiento basado en temáticas emergentes como migración y movilidad humana, movimientos sociales y proceso políticos, educación intercultural, mujeres indígenas y participación política, derechos, violencias e igualdad de género, la autonomía de los pueblos indígenas de la región, entre otros. Cabe destacar, que la investigación sobre estos temas se ha hecho en muchos casos de manera participativa, con integrantes de las comunidades y organizaciones vinculadas, dando como resultado una gran incidencia social inmediata en los diversos contextos.
Actualmente, hay cinco LGACs operantes en el programa de la maestría en sociología, mismas que se distribuyen en los tres diferentes CA´s pertenecientes al IIS-UABJO y un CA participante de la Facultad de Contaduría y Administración (FCA-UABJO); siendo estos los siguientes: